MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Acidiphilium cryptum JF-5 plasmid pACRY01

Total Repeats: 1023

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009467	CGC	2	6	26	31	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009467	CGC	2	6	74	79	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_009467	AGT	2	6	107	112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009467	GGGC	2	8	118	125	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_009467	CGG	2	6	9795	9800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_009467	AGCG	2	8	9826	9833	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_009467	GGT	2	6	9834	9839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009467	TTG	2	6	9844	9849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009467	GAGG	2	8	9855	9862	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_009467	CGA	2	6	10971	10976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009467	TGC	2	6	10997	11002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_009467	TGG	2	6	11030	11035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009467	GCG	2	6	11059	11064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009467	AAC	2	6	11087	11092	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009467	GAT	2	6	11104	11109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009467	GCA	2	6	11110	11115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009467	CTGG	2	8	11578	11585	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_009467	CGAA	2	8	11608	11615	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009467	TC	3	6	11623	11628	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_009467	CCTG	2	8	11632	11639	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
21	NC_009467	CTGG	2	8	11660	11667	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22	NC_009467	GC	3	6	11678	11683	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009467	TGA	2	6	11778	11783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009467	GAT	2	6	11785	11790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009467	CTT	2	6	11800	11805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_009467	GCTC	2	8	11818	11825	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009467	A	6	6	11837	11842	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009467	ACCC	2	8	11865	11872	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_009467	CAG	2	6	11876	11881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_009467	CAC	2	6	12678	12683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_009467	AGG	2	6	12776	12781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009467	GGC	2	6	13317	13322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009467	CG	3	6	13998	14003	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009467	GCC	2	6	14061	14066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_009467	CTC	2	6	15204	15209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_009467	TC	3	6	15208	15213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_009467	GCG	2	6	15221	15226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009467	TAC	2	6	15228	15233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_009467	GGGC	2	8	15250	15257	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_009467	ATC	2	6	15284	15289	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_009467	ATGC	2	8	15342	15349	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009467	TAT	2	6	15377	15382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009467	CG	3	6	15499	15504	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_009467	ATA	2	6	15538	15543	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009467	CTC	2	6	16641	16646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009467	CAA	2	6	16653	16658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009467	GGGA	2	8	16677	16684	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009467	GGC	2	6	16720	16725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009467	CG	3	6	16856	16861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_009467	TGTC	2	8	16897	16904	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_009467	GCG	2	6	16910	16915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009467	ATCG	2	8	16939	16946	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_009467	GGC	2	6	16982	16987	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_009467	CAT	2	6	17000	17005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009467	CGG	2	6	17039	17044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_009467	TGC	2	6	17055	17060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009467	GGC	2	6	17106	17111	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_009467	TG	3	6	17209	17214	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_009467	GGAC	2	8	17234	17241	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_009467	ACG	2	6	17244	17249	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009467	ATC	2	6	17273	17278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009467	CG	3	6	17314	17319	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_009467	TCT	2	6	17553	17558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009467	GGC	3	9	17595	17603	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009467	CA	3	6	17622	17627	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_009467	CCG	2	6	17645	17650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
67	NC_009467	CGC	2	6	17667	17672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_009467	GCC	2	6	17677	17682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_009467	GGC	2	6	17719	17724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009467	ACA	2	6	17729	17734	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009467	A	6	6	17801	17806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009467	TGT	2	6	17844	17849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009467	TGTC	2	8	17871	17878	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_009467	GA	3	6	17882	17887	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009467	CGG	2	6	17893	17898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009467	ATG	2	6	17912	17917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009467	GCA	2	6	17920	17925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_009467	ATC	2	6	17947	17952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009467	CGG	2	6	17967	17972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009467	ACGAA	2	10	18033	18042	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_009467	CTT	3	9	18123	18131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_009467	TGT	2	6	18139	18144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009467	T	8	8	18182	18189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009467	ACCC	2	8	20075	20082	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_009467	CCA	2	6	20272	20277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009467	AAC	2	6	20278	20283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_009467	C	6	6	20323	20328	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
88	NC_009467	TCC	2	6	20338	20343	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_009467	ATA	2	6	20344	20349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009467	GC	3	6	20400	20405	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_009467	GCC	2	6	20408	20413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_009467	CGA	2	6	20414	20419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009467	CGT	2	6	20426	20431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_009467	CAAT	2	8	20499	20506	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
95	NC_009467	GA	3	6	20529	20534	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_009467	ATA	2	6	20567	20572	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_009467	CTG	2	6	20591	20596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009467	ATTC	2	8	20668	20675	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_009467	TCC	2	6	20698	20703	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_009467	TCCTA	2	10	20713	20722	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
101	NC_009467	GCC	2	6	20980	20985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
102	NC_009467	GAT	2	6	21010	21015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009467	GTA	2	6	21073	21078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009467	TTC	2	6	21142	21147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_009467	AGC	2	6	21157	21162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_009467	GTC	2	6	21215	21220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_009467	GTA	2	6	21264	21269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009467	AC	5	10	21289	21298	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_009467	ATC	2	6	21301	21306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009467	GATT	2	8	21345	21352	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009467	ATC	2	6	21522	21527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_009467	CGT	2	6	21540	21545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_009467	GCCC	2	8	21609	21616	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
114	NC_009467	CGG	2	6	21644	21649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_009467	TCG	2	6	21685	21690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_009467	A	8	8	21761	21768	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009467	TCG	2	6	21789	21794	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_009467	TGG	2	6	21962	21967	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009467	CGT	2	6	22040	22045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_009467	CAT	2	6	22046	22051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_009467	TCGC	2	8	22086	22093	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009467	CGTA	2	8	22159	22166	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
123	NC_009467	CGT	2	6	22211	22216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_009467	GCC	2	6	22298	22303	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_009467	TGG	2	6	23716	23721	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009467	CCA	2	6	24997	25002	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_009467	TCC	2	6	25384	25389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_009467	ATG	2	6	25401	25406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009467	GA	3	6	25421	25426	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009467	ACC	2	6	25439	25444	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009467	CA	3	6	25487	25492	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_009467	CGC	2	6	25517	25522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_009467	CGG	2	6	25579	25584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009467	GGC	2	6	25605	25610	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_009467	CGGA	2	8	25612	25619	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_009467	CGG	2	6	25620	25625	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009467	TCA	2	6	25630	25635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_009467	CGAT	2	8	25657	25664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
139	NC_009467	CGG	2	6	27611	27616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009467	TTG	2	6	27677	27682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009467	GAGTG	2	10	27706	27715	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009467	AGC	3	9	27716	27724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009467	CGA	2	6	27755	27760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_009467	TCA	2	6	27807	27812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009467	GAA	2	6	27971	27976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009467	CGG	2	6	34737	34742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009467	TTC	2	6	34757	34762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
148	NC_009467	CCG	2	6	34867	34872	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
149	NC_009467	AGG	2	6	34902	34907	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_009467	CCG	2	6	35377	35382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
152	NC_009467	ACTC	2	8	35399	35406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
153	NC_009467	CGAG	2	8	35424	35431	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
154	NC_009467	TGA	2	6	44407	44412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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157	NC_009467	TCA	2	6	45827	45832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_009467	GAA	2	6	45865	45870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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160	NC_009467	CTT	2	6	45963	45968	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
161	NC_009467	CTC	2	6	45975	45980	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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172	NC_009467	TACCG	2	10	47875	47884	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
173	NC_009467	CCG	2	6	47963	47968	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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178	NC_009467	ACC	2	6	48170	48175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
179	NC_009467	CTG	2	6	48338	48343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_009467	CGT	2	6	48359	48364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
181	NC_009467	GCC	2	6	51327	51332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_009467	CCA	2	6	51346	51351	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_009467	GGC	2	6	51371	51376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_009467	GCC	2	6	51400	51405	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
185	NC_009467	TGG	2	6	51415	51420	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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188	NC_009467	CTT	2	6	51528	51533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
189	NC_009467	CGGC	2	8	51545	51552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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279	NC_009467	TAT	2	6	63929	63934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_009467	GATT	2	8	63994	64001	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
282	NC_009467	GAC	2	6	64069	64074	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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284	NC_009467	GGC	2	6	64088	64093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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423	NC_009467	GAT	2	6	91299	91304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
424	NC_009467	GC	4	8	91348	91355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
425	NC_009467	CCTGG	2	10	92243	92252	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
426	NC_009467	GTCG	2	8	92301	92308	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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434	NC_009467	CGC	2	6	92597	92602	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
435	NC_009467	CGC	2	6	92683	92688	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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438	NC_009467	TCA	2	6	92843	92848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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453	NC_009467	CTTA	2	8	96749	96756	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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